El 19 de julio se desarrollaron las elecciones de la filial en Guayaquil de la FEUE en medio de incidentes y con claras señales de irregularidades. Para este proceso electoral se habían presentado dos candidaturas: una alianza entre diferentes fuerzas democráticas estudiantiles entre las que se encontraba el FAU-JCE y la CMU, junto con otras fuerzas, alianza que se denomina Acuerdo Estudiantil por el Cambio, lista B; la otra era una alianza pública entre el friu-mpd y el miu-madera de guerrero, lista A. Ya a nadie sorprendió que los ultristas del mpd se hubieran aliado con los socialcristianos-madera de guerrero luego de verlos actuar juntos en la Asamblea Nacional. La campaña estuvo plagada de incidentes. Diariamente se veían a personas ajenas a la universidad circular por sus pasillos, con armas y actitudes provocadoras, impidiendo el ingreso a ciertas facultades a los candidatos de lista B, camionetas de la municipalidad de Guayaquil continuamente circulando en los predios universitarios, etc., incluso el día de las elecciones se capturó en los alrededores de la facultad de filosofía a una persona de apellido Chunga en posesión de una subametralladora, hecho que extrañamente no salió en los medios, y el detenido nunca llegó a las oficinas de la policía. El Consejo Universitario había designado una Comisión Electoral para que dirija este proceso, Consejo que resolvió que los estudiantes de las extensiones de la Facultad de Filosofía sufraguen en el coliseo de la facultad de Educación Física, esta decisión fue irrespetada por las autoridades de la facultad de filosofía y ese día se vieron llegar 30 buses de diferentes regiones del país con estudiantes que fueron llevados a sufragar en la facultad de filosofía y no en FEDER como se había dispuesto y donde los esperaban los delegados de la lista B en las mesas instaladas para el efecto. Este hecho fue impugnado, por lo que la Comisión Electoral decidió declarar nulas las elecciones en dicha facultad. Los resultados finales le dieron 19500 votos a la lista B y 22300 a la lista A, anulándosele a la misma más de 17000 votos de la facultad de Filosofía. Posteriormente la Comisión Electoral ordenó repetir las elecciones de manera general para el 4 de octubre de este año. Pero el día 4 de agosto sin constar en el orden del día el Consejo Universitario decide analizar el tema de las elecciones y proclama ganadora a la lista A, cuyos candidatos en su desesperación se posesionan ante quien dice ser el secretario nacional de la FEUE, militante del mpd, y no ante la Comisión Electoral la cual se niega a firmar el acta de posesión. Pesaron en esta decisión del Consejo Universitario que ese mismo día fue aprobada la nueva LOES a la que se opone la derecha y la seudo izquierda; pesaron el hecho de que según palabras de una autoridad universitaria afín al mpd "ya solo nos queda la Universidad de Guayaquil para enfrentar al gobierno"; pesaron el que el candidato de la lista A sea funcionario de la municipalidad de Guayaquil y dirigente de las juventudes nebotistas, Frente a este irrespeto a los principios democráticos un grupo de estudiantes han presentado una Acción de Protección para que el asunto sea resuelto por los jueces y además el movimiento estudiantil ha decidido actuar como FEUE Democrática hasta que se resuelva esta situación y así sumarse a la gran corriente estudiantil que viene pugnando por recuperar la FEUE de manos de quienes la han convertido en su apéndice y aparato de extorsión política.